home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ MacFormat 1994 August / August CD.bin / Shareware / Education / MacPattern 3.2 / Help Data / Help Data.rsrc / TEXT_404_Speed.txt < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1993-12-07  |  862 b   |  31 lines
  1. These tests were performed with MacPattern v3.0 using a Macintosh IIcx under System 7.1.
  2.  
  3. ‚Ä¢  Pattern analysis using PROSITE Rel. 10
  4.     (main set, 797 patterns)
  5.  
  6.     vs. SWISS-PROT TMAS_HUMAN (325 residues): 
  7.          5 sec
  8.     vs. SWISS-PROT 104K_THEPA (924 residues): 
  9.          6 secs
  10.  
  11. ‚Ä¢  Blocks analysis using Blocks Rel. 6
  12.     (2,302 blocks)
  13.  
  14.     vs. SWISS-PROT TMAS_HUMAN (325 residues): 
  15.         exact search   7:46 min
  16.         sensitivity 5:  5:51 min
  17.         sensitivity 1:  4:56 min
  18.  
  19. ‚Ä¢  Maximal segment score analysis (all scoring schemes):
  20.  
  21.     vs. SWISS-PROT TMAS_HUMAN (325 residues): 
  22.         2:30 min
  23.     vs. SWISS-PROT SODF_ECOLI (192 residues): 
  24.        0:55 min
  25.  
  26. ‚Ä¢  Database search using the PROSITE pattern
  27.     AMINO_ACID_PERMEASE vs. SWISS-PROT
  28.     Release 24 (28,154 entries), directly on
  29.     EMBL CD-ROM (PIR format): 
  30.        20 min.
  31.